Durch einen Quarantänealarm und eine anschließende Verschließung aller Türen in Atlantis sitzen kleinere Gruppen der Expeditionsteilnehmer in verschiedenen Teilen der Stadt fest.
Amelia Banks kommt im vierten Jahr zur Atlantis-Expedition dazu. Ihre Aufgabe ist es, die Gatefunktionen vom Kontrollraum aus zu überwachen, den Schild bei Bedarf ein- und auszuschalten, den Funkverkehr innerhalb von Atlantis zu überwachen, sowie den Außenteams per Funk zur Stelle zu sein und deren Anliegen an die zuständige Person in der Stadt weiterzuleiten.
Als Michael mit einigen Truppen in die Stadt eindringt, hilft sie, soweit sie kann. Teyla lässt ihren Sohn Torren John in Amelias Obhut, als sie aufbricht, um sich Michael zu stellen, da sie weiß, dass auf die Kontrollraum-Technikerin Verlass ist. Zudem hat Amelia Banks fünf Jahre Erfahrung im Kickboxen und kann so Teylas Sohn optimal beschützen.
Amelia verschafft sich durch ihre Leistungen sehr schnell Anerkennung in Atlantis. Bald wird auch klar, dass sie Interesse an einer Beziehung mit Ronon Dex hat.