Das Atlantis Team ist überrascht, als Michael an Bord eines Hive Schiffes wieder auftaucht mit einem Angebot, das die Fähigkeit der Wraith einen Krieg zu führen, deutlich schwächen würde.
Michael Kenmore ist laut Aussage der Atlanter Lieutnant bei der Air Force. Er selbst kann sich an seine Vergangenheit nicht erinnern, was angeblich daran liegt, dass er von den Wraith auf einer Mission gefangen genommen wurde und diese Gefangenschaft ihn beinahe vernichtet hätte.
Doch Michael hat Träume, auch von den Wraith. Deshalb besucht er des öfteren die Psychologin Dr. Heightmeyer. Irgendwann stellt er selbst Nachforschungen an und findet heraus, dass er eigentlich selbst ein Wraith ist. Dr. Beckett erklärt ihm daraufhin, was er an ihm getestet hat, mit fatalen Folgen. Michael dreht durch, kann zwar kurze Zeit darauf wieder ruhig gestellt und auf eine Alphabasis gebracht werden. Er flieht aber von dort mit Teyla im Schlepptau. Die Atlanter verfolgen ihn und können Teyla retten, aber Michael entwischt.
Nur wenig später, mittlerweile wieder Wraith, kehrt er nach Atlantis zurück, mit einer Flotte und unterbreitet den Atlantern ein Angebot. Er will verfeindete Clans mit dem Retro-Virus in Menschen transformieren, um so das Nahrungsangebot für seinen eigenen zu sichern. Die Atlanter lassen sich schließlich darauf ein, werden aber von ihm hintergangen.
Doch auch Michaels Pläne gehen nicht ganz auf. Seine Verbündeten befolgen seine Befehle nicht und so entschließt er sich ihnen eines auszuwischen, indem er die an Bord des Hives gefangenen Atlanter befreit und unterstützt.
Ronon will ihn zunächst töten, doch einigen sie sich dann darauf, gemeinsam zu fliehen.
Michael wird in Atlantis inhaftiert und führt eine Zeit lang moralische Gespräche mit Teyla. Er sieht ein, dass er nicht hier bleiben, aber auch nicht zurück kann. Als Teyla ihm vorschlägt, sich erneut dem Retro-Virus zu unterziehen, blockt er aber ab und macht klar, dass er lieber sterben würde.
Doch Ronon betäubt ihn und Beckett verabreicht ihm das Retro-Virus, ehe die Atlanter den Wraith in ein Camp auf einem anderen Planeten schaffen, wo auch die anderen transformierten Wraith waren.
Ein anderer Insasse des Camps bricht aus und konfrontiert eine Weile später Michael nach einem erneuten Gedächtnisverlust mit der Wahrheit und stachelt ihn so gegen die Atlanter an. Als Beckett Nachforschungen anstellt, dreht Michael den Spieß um und lässt ihn schließlich gefesselt und bewusstlos im Camp zurück, während er selbst, flieht.
Michael nimmt die Atlanter ein weiteres Mal gefangen, nachdem es ihm gelingt, den Retro-Virus umzukehren und eine weitaus gefährlichere Rasse zu erschaffen. Wiederum ist Teyla sein Hauptopfer, auf das er sich konzentriert. Als die anderen Atlanter aber schließlich auftauchen, um die Athosianerin zu befreien, verschwindet Michael.