McKay befindet sich an Bord der Daedalus auf dem Rückflug von der Erde zurück nach Atlantis. Immer mehr Probleme mit dem neuen Schiff zeigen sich und McKay findet heraus, dass ein Wraith-Computervirus die Schiffssysteme befallen hat.
Lieutenant Mark Stern dient in der USAF und gehört dem Brückenpersonal der Daedalus an. So ist er auch auf der Daedalus, als diese nach einem Aufenthalt auf der Erde zurückkehrt und ihre Systeme allerdings nach einem Kampf mit Wraith-Schiffen mit einem Wraith-Virus infiziert sind.
Stern bemerkt, dass ein Notsignal ausgesendet wird und unterrichtet die anderen darüber. Während sie weiter gegen den Computervirus vorgehen, beobachtet der Lieutenant stets die Systeme.
Schließlich gelingt es ihnen den Computervirus zu überlisten und sie erreichen Atlantis.