Mehrere Bewohner von Atlantis sind mit einem tödlichen Nanovirus infiziert, welches eine Abschottung der Stadt nach sich zieht.
Johnson ist eine Wissenschaftlerin, die mit dem ersten Expeditionstrupp nach Atlantis kam. Sie gehört zu dem Wissenschaftler-Team, das mit McKay und Zelenka die unteren Ebenen der Stadt erkundet, nachdem diese von dem Sturm schwer beschädigt wurden.
Sie und Wagner erkunden einige Labore. Nach etwa 12 Stunden werden die beiden von Halluzinationen in den Wahnsinn getrieben. Sie nehmen per Funk noch Kontakt zu den anderen Wissenschaftlern auf, doch jede Hilfe kommt zu spät. Wagner stirbt, bevor die anderen eintreffen. Johnson erklärt ihnen im Wahn noch, was sie sieht, doch kurz darauf stirbt sie an einer Hirnblutung.