Die Bemühungen, mit einer Rasse namens Genii Handelsbeziehungen einzugehen, schlagen fehl, als das Team entdeckt, dass ihre neuen "Alliierten" fragwürdige Motive haben.
Cowen ist der Anführer der Genii. Er sorgt dafür, dass die wahre Identität der Genii im Verborgenen bleibt und führt mit einigen anderen teils ein Leben über der Erde in der Tarnung, ein ganz schlichte Bauernleben zu führen.
Als die Atlanter herausfinden, dass die Genii auch im Untergrund ein Leben führen, und zwar ein wesentlich weiterentwickeltes, als sie oberflächlich vorgegeben hatten, lässt er sie gefangen nehmen, aber verhandelt schließlich weiter.
Sie sollen seinen Wissenschaftler helfen, Atombomben zu bauen sowie an diverse Wraith-Techniken zu gelangen.
Er schließt sich der gemeinsamen Mission auf ein Basisschiff an und überlistet die Atlanter schließlich, nimmt ihnen die ergatterte Gerätschaft ab. Doch er war nicht der einzige mit einem Plan B und so muss er schlussendlich nachgeben und Sheppards Team die wertvolle Technik überlassen.
Als Atlantis aufgrund eines Sturms evakuiert wird, erhält er Nachricht von den Maranianern und entsendet schließlich Kommandant Kolya, um die Stadt unter die Herrschaft der Genii zu bekommen.
Dies entpuppt sich allerdings als Fehler, und nicht als einziger, den er hinnehmen muss. Denn einige Genii planen einen Putsch gegen Cowen, der zu immer brutaleren Maßnahmen greift.
Ladon Radim gelingt der Staatsstreich, der den gnadenlosen Genii-Anführer das Leben kostet.