Die Zeit läuft ab! Während Major Sheppard mit einem fremdartigen Käfer ringt, der ihm das Leben auszusaugen scheint, muss das Team einen beschädigten Jumper zurück nach Atlantis bringen - nur steckt dieser im Stargate fest.
Dr. Peter Kavanagh gehört von Anfang an zum Atlantis Team, hat wegen seiner aufdringlichen und arroganten Art allerdings nicht viele Freunde in der verlorenen Stadt gefunden.
Eine seiner ersten wichtigen Arbeiten nach seiner Ankunft ist, eine Lösung zu finden, als der Puddle Jumper wegen eines kaputten Triebwerks im Stargate stecken geblieben ist. Vor dem ganzen Raum voll Wissenschaftler tut er seine Meinung laut kund, was zu den ersten Problemen mit Expeditionsleiterin Dr. Weir führt. Kavanagh möchte den Schild aktivieren, um bei einer Explosion zumindest die Stadt zu schützen, doch Weir will diese Option gar nicht in Betracht ziehen. Als der Jumper dann schließlich freigegeben wird, sich aber nicht bewegt, ist es Kavanaghs Idee, die Heckluke zu öffnen, um Antriebskraft zu gewinnen.
Vor der Belagerung durch die Wraith gestattet man jedem Expeditionsmitglied eine Videonachricht an Freunde oder Familie loszuschicken. Kavanagh jedoch nutzt diese Gelegenheit, um das SG-C über Dr. Weirs Unfähigkeit in Kenntnis zu setzen.
Schließlich lässt er sich auf die Daedalus versetzen, wo er eng mit dem Asgard zusammenarbeitet. Doch dieser Versetzungswunsch lässt ihn in Verdacht geraten, denn irgendwie war eine Bombe nach Atlantis gelangt, wobei sich später herausstellt, dass das Stargate selbst in eine Bombe verwandelt worden war. In einem Verhör redet er sich um Kopf und Kragen. Das Team ist bis zum Ende hin nicht von seiner Unschuld überzeugt und nach einer kurzen Diskussion schicken sie Ronon zu ihm, um an wichtige Informationen zu gelangen. Kaum sieht Kavanagh allerdings den Satedaner, fällt er auch schon in Ohnmacht. Allerdings muss das Team feststellen, dass Kavanagh wirklich nichts mit der Sache zu tun hatte.
Seinen nächsten Arbeitsplatz stellt die Mittelstation dar. Bill Lee kümmerte sich um seine Einführung. Die Wraith erfahren allerdings von der Station und sehen sie als die perfekte Möglichkeit, zu neuen Weidegründen zu gelangen. Sie greifen die Mittelstation an und möchten von drei der Wissenschaftler die Freischaltungscodes erfahren. Einer von ihnen stirbt und Kavanagh wäre das nächste Opfer, als er auch wieder ohnmächtig wird. Das Atlantis-Team trifft ein und hilft ihnen aus dieser Situation heraus und Lee, McKay und schlussendlich auch Kavanagh arbeiten daran, das Stargate zu deaktivieren, um die Wraith daran zu hindern, in die Milchstraße zu gelangen. Kavanghs Lösung hat die Selbstzerstörung der Station zur Folge.
Nach diesem Fiasko bewirbt er sich erneut für einen Posten auf der Daedalus und wird dort wieder angenommen.