"Whispers" führt ein neues SG-Team ein, das sich gänzlich aus Frauen zusammensetzt, angeführt von Major Anne Teldy, einer Bilderbuchsoldatin Mitte 30. Dieser Charakter wurde übrigens nach Anne Teldy, einem weiblichen Fan aus Joe Mallozzis Bog, benannt, der diese Ehre als einmillionste Besucherin der Seite zuteil wurde. Weiterhin besteht das Team aus Sgt. Dusty Wells, einer taffen jungen Frau Mitte 20, die die Erde verlassen hat, um Bösewichter zu jagen, Cpt. Alicia Vegas, gespielt von Leela Savasta und Dr. Alison Porter, einer niedlichen Wissenschaftlerin, die wohl Gerüchten zufolge eine kleine Romanze mit Dr. Beckett aufkommen lässt.
Zum Inhalt der Folge:
Das Team von Major Teldy fordert Sheppard und Dr. Beckett als Unterstützung an, nachdem es auf einem Planeten eines von Michaels älteren Forschungslaboren gefunden hat. Das Labor befindet sich einem weitverzweigten Höhlensystem und beherbergt ein Dutzend menschlicher Körper in Stasis, vermutlich Testobjekte von Michael.
Carson Beckett - oder präziser ausgedrückt -, der Klon des Doktors ist gerade erst wieder nach einer Erholungsphase auf der Erde nach Atlantis zurückgekehrt. Auf ihrem Weg zum Treffpunkt, der sich zu Becketts Leidwesen weit entfernt vom Stargate befindet, vergleichen Sheppard und er ihre Stasis-Erfahrungen. Sheppard führt aus, dass er wohl Beckett geschlagen hat, da er sich 800 Jahre darin befunden hat und nicht nur 2 Monate wie der Doktor.

Während sich Teldy, Sheppard und die anderen Militärs die Zeit vertreiben untersuchen Beckett und Porter die Stasiskapseln und die darin enthaltenden Testobjekte genauer, doch sie entscheiden sich dafür, diese nicht eher wiederzubeleben, bevor sie nicht genaueres über deren Zustand wissen. Um das tun zu können, bitten sie darum, über Nacht zu bleiben. Somit beschließt das Team, sich einem nahe gelegenen, verlassen Dorf einzuquartieren.
Als Sheppard und Teldy die nötigen Vorbereitungen treffen, begegnen sie einem einzelnen Mann aus einem anderen Dorf, Mirellus. Dieser erzählt ihnen, dass das Dorf verflucht sei. Vor etwa eineinhalb Jahren begannen die Bewohner zu verschwinden und letzten Endes verließen die verbliebenen Dorfbewohner ihr Zuhause, weil sie glaubten, dass hier eine böse Kreatur ihr Unwesen triebe. Mirellus hatte zudem beobachtet, wie Sheppard aus dem Teil der Höhlen kam, von dem er glaubt, dass er ebenso von wilden Tieren heimgesucht wird. Doch dann tut Mirellus etwas sehr Dummes und bringt damit das gesamte Team in erhebliche Gefahr. Sie werden plötzlich von einem blendenen Nebel einghüllt, der sowohl ihre Lampen als auch ihre Elektronik zu beeinflussen scheint, und in diesem voneinander getrennt ...