Vor Jahren gehörte Burke zu einem Team bestehend aus ihm, Jack O’Neill und Woods. Jedoch wurde Woods bei einer Mission getötet und Burke wurde dafür verantwortlich gemacht. Lange erzählt er nicht, was tatsächlich geschehen ist, meint stattdessen, dass sie beide während der Mission improvisieren wollten, um O’Neill zu helfen, und er dabei Woods versehentlich für den Feind gehalten hatte. Wegen des Vorfalls wurde der CIA Agent nach Honduras versetzt, wofür er indirekt Jack verantwortlich macht, der sich seiner Meinung nach vor Gericht nicht genug für ihn ausgesprochen hatte.
Als Daniel Jackson und Bill Lee von Terroristen entführt werden, ist er der einzige, der helfen kann und er bittet darum mit O’Neill zusammenzuarbeiten. Er trifft sich mit Jack und er gibt ihm Informationen über die derzeitige Lage in Honduras und er meint, dass er weiß, wo Jackson und Lee hingebracht wurden. Jedoch kommt das Gespräch auch bald auf den längst vergangenen Vorfall. Jack geht mit einem einheimischen Führer los und lässt Burke zurück.
Allerdings folgt ihnen der CIA Agent und will O’Neill doch helfen. Zu zweit schlagen sie sich weiter durch den Dschungel, noch immer auf der Suche nach Jackson und Lee. Dabei überwindet sich Burke auch, endlich die Wahrheit zu sagen. Scheinbar wollte er nichts sagen, weil Cindy - Woods Frau - keine Pension bekommen hätte und er ihr das nicht antun wollte. Er erzählt, dass Woods ihre Position an ihre Feinde weitergegeben hätte und übergelaufen wäre. Woods hat gemerkt, dass Burke dies weiß und wollte ihn bereits umbringen, doch Burke kam ihm zuvor und erschoss ihn.
Schließlich stoßen sie auf die Terroristen und greifen sie an. Burke erschießt den Terroristen Chalo. Als alles vorbei ist, verspricht ihm O’Neill, dass er sich für eine Versetzung in eine angenehmere Umgebung aussprechen wird.
Erster Auftritt - Stargate: SG-1
Evolution, Teil 2
Evolution, Part 2
O'Neill nimmt die Hilfe eines ehemaligen Kameraden an, um Daniel und Dr. Lee zu retten, die in Zentral Amerika entführt wurden. Währenddessen infiltrieren Carter, Teal'c und Jacob die Fabrik, in der Anubis seine Supersoldaten herstellt. (Teil 2 von 2)