Zehn Jahre nach den Ereignissen aus "Der falsche Klon" steckt Jack O'Neills Klon in Schwierigkeiten und zieht somit die Aufmerksamkeit von Homeland Security auf sich.
Während Daniel Jackson drastische Maßnahmen vorschlägt, um den jungen Jack O'Neill untertauchen zu lassen, muss sich General O'Neill darüber im Klaren werden, wieviel er bereit ist, für den jungen Mann zu riskieren. Der Klon muss derweil entscheiden, inwieweit er den Leuten Vertrauen schenkt, die ihn vor zehn Jahren im Stich gelassen haben.